Aula Collegium Maius, zwana również Jagiellońską, była dawniej salą wykładową teologów. Usytuowana jest w najstarszej części Collegium Maius, na miejscu kamienicy należącej dawniej do rycerza Pęcherza z Rzeszotar.

Na portalu prowadzącym ze Skarbca Kopernika znajdujemy z kolei dewizę Uniwersytetu wprowadzoną do statutu uczelni po II wojnie światowej: Plus ratio quam vis, co znaczy „Więcej rozumem niż siłą”.

Ściany Auli zdobią portrety przedstawiające najważniejsze postacie związane z dziejami Uniwersytetu: polskich królów, biskupów krakowskich (kanclerzy Uniwersytetu Krakowskiego), a przede wszystkim najwybitniejszych profesorów, w tym rektorów.