W centralnej części sali znajduje się katedra z dekoracyjnym baldachimem przedstawiającym alegorię czterech pierwszych wydziałów: [od lewej] Wydziału Sztuk Wyzwolonych, Medycyny, Prawa i Teologii. Obecnie Uniwersytet Jagielloński liczy 16 wydziałów.

Na końcu pomieszczenia znajdujemy kamienny portal pochodzący z krakowskiego ratusza. Manierystyczne drzwi pochodzące z 1593 r. prowadziły w ratuszu do Izby Pańskiej. Trafiły one do zbiorów uniwersyteckich w drugiej połowie XIX wieku.

W Auli Jagiellońskiej do dnia dzisiejszego odbywają się ważne uroczystości uniwersyteckie. W tej sali Papież Jan Paweł II odbierał tytuł doktora honoris causa w 1983 roku. Nad wyjściem eksponowany jest obraz autorstwa artysty Leszka Sobockiego przedstawiający papieża z dłońmi uniesionymi na wysokości klatki piersiowej, w geście osłaniającym kulę, która – w intencji artysty – symbolizuje świat.

W tym miejscu kończy się zwiedzanie Muzeum Uniwersytetu Jagiellońskiego Collegium Maius. Zapraszamy na dziedziniec i na stoisko promocyjne Uniwersytetu ulokowane w historycznych lektoriach, gdzie można zakupić pamiątki i publikacje związane z tym wyjątkowym miejscem.