Fabryka Emalia Oskara Schindlera jest częścią Trasy Pamięci Muzeum Krakowa. W jej skład wchodzą oddziały Muzeum zajmujące się historią Krakowa okresu II wojny światowej: Ulica Pomorska, Fabryka Schindlera, Apteka pod Orłem, Miejsce Pamięci KL Plaszow. Oddział Ulica Pomorska znajduje się w budynku dawnej siedziby Gestapo. W celach aresztu podręcznego zachowały się inskrypcje wykonane przez więźniów, a w dawnej kantynie prezentowana jest wystawa stała Krakowianie wobec terroru 1939-1945-1956. Fabryka Schindlera przedstawia historię okupowanego miasta. Apteka pod Orłem opowiada historię getta i apteki prowadzonej na jego terenie w czasie wojny przez Tadeusza Pankiewicza, odznaczonego po wojnie medalem Sprawiedliwy wśród Narodów Świata. Teren byłego obozu koncentracyjnego Plaszow znajduje się około 3 km od muzeum. W 1943 roku do obozu zostali przesiedleni Żydzi z krakowskiego getta. Na terenie obozu działał również obóz pracy dla Polaków. Obóz działał do 1945 roku. Obecnie prezentowana jest tam wystawa plenerowa KL Plaszow.