Pod ratuszem znajdują się zabytkowe piwnice. Pierwotnie funkcjonowały 4 piwnice z bezpośrednim wejściem usytuowanym w południowej fasadzie ratusza, w pobliżu wschodniego naroża budynku. Przed ostatnim remontem podziemi ratusza funkcjonowały cztery piwnice połączone przejściami. Podstawowym materiałem budowlanym, z którego zbudowano piwnice stanowi kamień warstwowy i cegła. Podobne piwnice znajdują się pod Klasztorem oo. Franciszkanów, biblioteką (starą synagogą), Grodem Starościńskim, Szpitalem św. Ducha oraz wieloma innymi budynkami w Bieczu. Służyły m.in. do składowania beczek z winem węgierskim, które było ważnym towarem handlowym. Wg podań Biecz posiada podziemne przejście, które łączyło zamek z Kolegiatą Bożego Ciała. Korytarz wiedzie podobno, aż do Klasztoru Franciszkanów.