Laboratorium ekotoksykologiczne IB PAN wyposażone jest w wysokiej jakości urządzenia pomiarowe (do najważniejszych należą spektrofotometry i chromatografy), co stwarza możliwość wykonywania specjalistycznych analiz roślin, gleb i wód z zakresu ekotoksykologii. Wydzielono w nim specjalistyczne pomieszczenia, jak np. laboratoria chromatograficzne, laboratorium spektrofotometrii, laboratorium analiz siarki i węgla, laboratorium analiz azotu.

W oparciu o wykonywane analizy chemiczne realizowane są wszystkie projekty badawcze pracowników tej jednostki, zarówno w ramach działalności statutowej, jak i projektów finansowanych przez inne podmioty.

Laboratorium Zakładu Ekologii współpracuje z:

• Instytutem Dendrologii Polskiej Akademii Nauk w Kórniku
• Instytutem Botaniki Uniwersytetu Jagiellońskiego
• Fundacją Botaniki Polskiej w Krakowie
• Uniwersytetem Śląskim w Katowicach
• okresowo z innymi jednostkami krajowymi, które zainteresowane są wykonaniem analiz chemicznych
• Centre for Ecology & Hydrology. Natural Environmental Research Council, Bangor, United Kingdom
• Frank Laboratory of Neutron Physics, Joint Institute for Nuclear Research, Dubna, Russian Federation.