Die Aula Collegium Maius, auch Jagiellonen-Aula genannt, war früher ein Hörsaal der Theologen. Sie befindet sich im ältesten Teil des Collegium Maius, an der Stelle des älteren Bürgerhauses „Pęcherz“. Auf dem Portal, das den Ausgang der Kopernikus-Schatzkammer schmückt, ist das Motto der Universität zu sehen, das nach dem Zweiten Weltkrieg in ihre Statuten aufgenommen wurde: Plus ratio quam vis (Mehr mit Verstand als mit Kraft). Die Wände der Aula sind mit den Porträts der wichtigsten Persönlichkeiten in der Geschichte der Universität verziert: polnische Könige, Bischöfe von Krakau (Kanzler der Krakauer Akademie) und vor allem die bedeutendsten Professoren, darunter die Rektoren.