Budowla ma konstrukcję zrębową, ściany oszalowane są zarówno na zewnątrz, jak i wewnątrz pionowo ułożonymi deskami. Kościół otoczony jest podcieniem nawiązującym do dawnych sobót. Wewnątrz kościoła uwagę zwraca przede wszystkim bogato zdobiony główny ołtarz. Utrzymany w stylu neogotyckim, będący dziełem austriackiego mistrza Ferdynanda Prinotha. Do dziś można podziwiać również dwa dzwony i sygnaturkę ufundowaną w 1912 roku. Okna zdobią piękne witraże z 1937 roku. W latach osiemdziesiątych dekorację wnętrza świątyni wykonał zakopiański rzeźbiarz Michał Gąsienica Szostak. Kościół jest prowadzony przez salezjanów. W 1937 roku amerykański dziennikarz Julien Bryan – uznany dokumentalista, znany między innymi z ujęć nakręconych w trakcie obrony Warszawy w 1939 roku w witowiańskim kościele nakręcił dwa filmy: fragmenty mszy świętej oraz wyjście wiernych z kościoła. Stanowią część Archiwum Filmowego Stevena Spielberga i można je obejrzeć na stronach internetowych Amerykańskiego Muzeum Pamięci o Holokauście.

Kościół znajduje się na Szlaku Architektury Drewnianej w Małopolsce.