Tutaj dzieje i historia zapisane są w numizmatach, starych mapach i drukach. Hrabia Emeryk Hutten-Czapski był osobowością wszechstronną. Pasjonował się numizmatyką, był bibliofilem, zbieraczem grafiki, dzieł sztuki oraz pamiątek polskich. Muzeum jego imienia to najstarszy i największy oddział Muzeum Narodowego w Krakowie. Głównym budynkiem jest wybudowany w 1884 roku według projektu Antoniego Siedeka, neoklasyczny Pałacyk Czapskich. Można tam  dziś podziwiać jego kolekcję unikatowych, czy wręcz legendarnych monet, a także medale, rzadkie starodruki i mapy. Na wystawie stałej można zobaczyć ponad 2500 cennych obiektów. Pałac jest otoczony przez piękny ogród ze stuletnimi drzewami, w którym znajdują się fragmenty krakowskich, gotyckich budowli, na przykład czternastowieczna kamienna wieżyczka z kościoła Mariackiego. W XXI wieku powstał tu nowoczesny Pawilon Józefa Czapskiego poświęcony wnukowi kolekcjonera, związanemu z paryską „Kulturą”; wybitnemu intelektualiście, pisarzowi, malarzowi i krytykowi sztuki. W muzeum prowadzone są warsztaty i zajęcia edukacyjne dla dzieci i dorosłych.