Dawniej Zagóra, jeden z przysiółków Czarnej Góry, należał do parafii w sąsiedniej wsi Trybsz. W 1948 roku jego mieszkańcy wybudowali mały, kamienny kościółek, do którego na msze przywozili proboszcza z Trybsza. W latach 70. XX wieku dobudowali plebanię. Ze względu na zły stan kościoła ojciec Hubert Kasztelan Ocist wokół starej budowli rozpoczął budowę większego kościoła, który wzniesiono w latach 1993–1995. W 1995 roku konsekrował go kardynał Franciszek Macharski. W 1996 roku powołano cysterską parafię zależną od opactwa w Mogile.

Kościół w stylu regionalnym zaprojektował architekt Stanisław Tylka z Zakopanego. W świątyni umieszczono ołtarz główny i organy z poprzedniej świątyni. Malowidła ścienne wykonał ukraiński artysta Wasyl Krasiocha ze Stanisławowa. Ciekawy jest obraz Ostatniej Wieczerzy z portretami budowniczych kościoła na tle tatrzańskiego krajobrazu.

Świątynię otaczają rzeźbione stacje różańcowe i drogi krzyżowej. U podnóża kościoła znajduje się grota Matki Boskiej Fatimskiej, a przy plebanii dom pielgrzyma, hala sportowa, dwa ośrodki wypoczynkowe, boiska sportowe, letni basen i plac zabaw dla dzieci.