Originálna, moderná forma budovy, v ktorej sa nachádza múzeum, je dielom slávneho japonského súčasného architekta Arata Izosaki, iniciátorom vzniku múzea bol známy poľský filmový režisér Andrzej Wajda. Budova svojím charakterom nadväzuje nielen do modernej, ale aj tradičnej japonskej architektúry.Základom zbierok múzea je kolekcia spisovateľa a zberateľa Felixa Jasieńského (1861-1929), ktorú krakovskému Národnému múzeu podaroval v r. 1920. Jasińský, zafascinovaný kultúrou Japonska, nosil prezývku Manggha. Obrovská kolekcia japonského umenia zahŕňa 6,5 tis. exponátov. Značnú časť predstavujú grafiky drevorezby najväčších japonských majstrov zo XVII.-XIX- st., o. i. Suzuki Harunobu, nazývaného „otcom japonskej farebnej drevorezby“, ako aj známych Kitagawy Utamaro a Ichiryūsai Hiroshige. Zaujímavé sú aj japonské militária: ozdobné meče a štíty, samurajské výzbroje spolu s prilbami a maskami. Neobyčajne majstrovské sú predmety vyrobené z laku, také ako puzdierka, škatuľky, čaše a miniatúrny nábytokManggha nie je len obyčajným múzeom, ale aj aktívnym kultúrnym centrom. Organizuje sa tu mnoho udalostí a podujatí, popularizujúcich vedomosti o Japonsku, jeho kultúre, umení, zvykoch.