Auf dem Gelände der im Bau befindlichen Wohnsiedlung „Tysiąclecia“ wurden die Messen von Pfarrer Józef Kurzeja zelebriert, der aus Raciborowice anreiste und Vikar der Gemeinde Raciborowice war, zu der das Dorf Mistrzejowice gehörte. 1970 errichtete man im Wald eine grün gestrichene Baracke mit einem Feldaltar, der das Bild von Maximilian Maria Kolbe zeigte, genannt „Grüner Schuppen“. Die damalige Verwaltung erlaubte die Gründung einer neuen Kirchengemeinde nicht, doch Pater Kurzeja wurde von Kardinal Karol Wojtyła und den Einwohnern von Nowa Huta dabei aktiv unterstützt. 1973 wurde in der Siedlung eine provisorische Kapelle und auf dem Kirchhof der Grüne Schuppen aufgestellt. Die in den Jahren 1976 bis 1983 nach einem Entwurf von Józef Dutkiewicz errichtete Kirche wurde von Papst Johannes Paul II. während seiner zweiten Pilgerreise nach Polen eingeweiht.

Die Kirche besteht aus zwei Geschoßen, einem Pfarrhaus und 10 Räumen für Religionsunterricht. Die Wände der Kirche und des Pfarrhauses wurden mit weißem Pińczów-Stein verkleidet, die Treppe mit rotem Szydłowiec-Sandstein. Die Oberkirche bietet Platz für 5000 Gläubige. Der Hauptaltar beherbergt eine rund sechs Meter hohe Statue des gekreuzigten Christi sowie die Madonna von der Unbefleckten Empfängnis und die Darstellung des Heiligen Maximilian Maria Kolbe. Der Tabernakel wird von Engelsfiguren getragen. Alle Skulpturen wurden von Kazimierz Gustaw Zemła angefertigt. Das in Bronze gegossene Taufbecken erinnert an die Taufe der Adelsrepublik Dreier Nationen. 1982 stiftete Papst Johannes Paul II. der Kirche roten schwedischen Granit für den Bodenbelag und weißen Carrara-Marmor für den Altar, dessen Hintergrund aus italienischem Travertin gefertigt wurde.

Die untere Kirche bietet Platz für 2000 Gläubige. In der Krypta befindet sich ein Marmorsarkophag für den Pater Józef Kurzeja. Über dem Altar hängt eine Statue des gekreuzigten Jesu, ein Werk des Bildhauers Bronisław Chromy, und an den Seiten sind orthodoxe Darstellungen von Heiligen zu sehen. Pater Henryk Jankowski, Jerzy Popiełuszko und der Solidarność-Anführer Lech Wałęsa nahmen hier mehrmals an Heiligen Messen teil.

Auf dem Kirchplatz wurde 1991 ein von Professor Gustaw Zemła entworfenes Denkmal für Johannes Paul II. enthüllt, 2006 wurde in der Nähe ein Obelisk aus Stein mit der Darstellung des Priesters Kazimierz Jancarz aufgestellt. Nach der Verhängung des Kriegsrechts in Polen am 13. Dezember 1981 wurde Pater Kazimierz Jancarz zum Seelsorger der Arbeiter ernannt und gründete angesichts ihres stetig wachsenden Engagements den Seelsorgedienst für die Arbeiter in der Kirchengemeinde Mistrzejowice. Seit 1984 fanden hier donnerstags Gottesdienste für das Vaterland statt, zu denen Tausende von Gläubigen kamen.