Den Grundstein für den Bau des Heiligtums legte 1984 feierlich der Krakauer Metropolit, Kardinal Franciszek Macharski. Der Grundstein stammte aus der Basilika San Francesco in Assisi und war von Johannes Paul II. geweiht worden. Die Kirche in Nachbarschaft des Generalhauses der Kongregation der Albertinerinnen wurde von Marzena Popławska und Wojciech Kosiński entworfen. Sie wurde in den Jahren 1982–1985 errichtet und 1997 zum Heiligtum erklärt. Bruder Albert war populär. Die Menschen baten im Gebet um seine Fürsprache bei Gott. Der Künstler, der seine Karriere als Maler aufgab, um mit Obdachlosen und Notleidenden zu wohnen, war in Krakau und darüber hinaus eine geschätzte Persönlichkeit. Der Einleitung des Seligsprechungsprozesses ging die 1932 erfolgte Exhumierung des Heiligen voraus, dessen sterbliche Überreste in einen neuen Sarg gebettet und erneut in einer Grabstätte auf dem Krakauer Rakowicki-Friedhof beigesetzt worden sind. In der Kirche befindet sich am Hauptaltar das schöne Gemälde des gegeißelten Christus Ecce Homo, ein Werk des Heiligen Bruder Albert. Hier werden ebenfalls Reliquien des Heiligen sowie der seligen Schwester Bernardyna, der ersten Generaloberin der Albertinerinnen, aufbewahrt. Das Ablassfest zum Gedenken an den Heiligen Bruder Albert findet am 17. Juni statt, das Ablassfest am Gedenktag der seligen Schwester Bernardyna am 22. September. In der Kirche wird der Freitag vor dem Palmsonntag während des jährlichen Ablassfestes Christus Ecce Homo besonders feierlich begangen.